MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 10863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009900	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009900	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009900	TGT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009900	ACA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009900	TTG	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009900	TA	3	6	1015	1020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009900	TAA	2	6	1034	1039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009900	A	7	7	1049	1055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009900	T	6	6	1060	1065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009900	GTT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009900	T	8	8	6081	6088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009900	CTT	2	6	6100	6105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009900	ATA	2	6	6127	6132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009900	GTT	2	6	6210	6215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009900	GAT	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009900	TA	3	6	6249	6254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009900	AAC	3	9	6265	6273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009900	CAA	2	6	6316	6321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009900	T	7	7	6328	6334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009900	ATT	2	6	6338	6343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009900	TTC	2	6	6363	6368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009900	TAA	2	6	6416	6421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009900	CTT	2	6	6436	6441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009900	GTT	2	6	6465	6470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009900	AT	3	6	6475	6480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009900	TCT	2	6	7770	7775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009900	TTA	2	6	7843	7848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009900	GCCTAT	2	12	7869	7880	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009900	GAC	2	6	7895	7900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009900	CAA	3	9	7914	7922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009900	TA	3	6	9012	9017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009900	TAT	2	6	9029	9034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009900	CAA	2	6	9036	9041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009900	AGC	2	6	9098	9103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009900	ATA	2	6	9130	9135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009900	CAA	2	6	9207	9212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009900	A	7	7	9238	9244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009900	AAG	2	6	9337	9342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009900	AATTA	2	10	9343	9352	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009900	AT	3	6	9353	9358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009900	TAA	2	6	9403	9408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009900	AAC	2	6	9475	9480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009900	GGT	2	6	9493	9498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009900	A	7	7	9558	9564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009900	AGT	2	6	9574	9579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009900	GGT	2	6	9590	9595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009900	GCT	2	6	9603	9608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009900	TAA	2	6	9666	9671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009900	AGA	2	6	9750	9755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009900	A	6	6	9826	9831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009900	TA	3	6	9844	9849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009900	GT	3	6	9854	9859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009900	TGA	2	6	9910	9915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009900	TA	3	6	9955	9960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009900	A	6	6	9975	9980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009900	AGT	2	6	9991	9996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009900	TGG	2	6	10012	10017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009900	AAT	2	6	10026	10031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009900	TGA	2	6	10049	10054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009900	GCA	2	6	10062	10067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009900	ATA	2	6	10087	10092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009900	TAA	2	6	10124	10129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009900	TGG	2	6	10176	10181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009900	TAC	2	6	10183	10188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009900	TGT	2	6	10192	10197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009900	GTT	2	6	10248	10253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009900	TGA	2	6	10282	10287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009900	ATA	2	6	10290	10295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009900	AAG	2	6	10332	10337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009900	TAA	2	6	10341	10346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009900	AAC	2	6	10442	10447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009900	TTG	2	6	10550	10555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009900	ATC	2	6	10673	10678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009900	GTT	2	6	10693	10698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009900	GTA	2	6	10780	10785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009900	ACT	2	6	10826	10831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009900	TTG	2	6	10841	10846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009900	CTT	2	6	10891	10896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009900	AGA	2	6	10964	10969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009900	TATT	2	8	10979	10986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009900	T	7	7	11001	11007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009900	AAAGAC	2	12	11011	11022	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009900	TTA	2	6	11023	11028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009900	AAC	2	6	11053	11058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009900	ATT	2	6	11091	11096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009900	TA	3	6	11205	11210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009900	ATTA	2	8	11213	11220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009900	TTA	2	6	11225	11230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009900	ATT	3	9	11244	11252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009900	T	6	6	11298	11303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009900	A	7	7	11331	11337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009900	A	6	6	11359	11364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009900	TTTA	2	8	11367	11374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009900	T	6	6	11389	11394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009900	TGT	2	6	11404	11409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009900	TAA	2	6	11418	11423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009900	ATT	2	6	11485	11490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009900	AAT	2	6	11500	11505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009900	GCA	2	6	11518	11523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009900	TAA	2	6	11527	11532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009900	T	6	6	11558	11563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009900	CTT	2	6	11762	11767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009900	CAG	2	6	11780	11785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009900	TAT	2	6	11801	11806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009900	GATT	2	8	11821	11828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009900	AAAT	2	8	11829	11836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009900	T	6	6	11842	11847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009900	AATT	2	8	11856	11863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009900	CTT	2	6	11870	11875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009900	T	6	6	11874	11879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009900	TAT	2	6	11898	11903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009900	TA	3	6	11942	11947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009900	TCA	2	6	11953	11958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009900	TGG	3	9	12026	12034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009900	TA	3	6	12106	12111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009900	TCG	2	6	12136	12141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009900	CTC	2	6	12185	12190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009900	TGA	2	6	12221	12226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009900	TTA	2	6	12251	12256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009900	AAGAAA	2	12	12263	12274	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009900	CTTT	2	8	12407	12414	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009900	A	7	7	12550	12556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009900	TGA	2	6	12570	12575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009900	CAA	2	6	12578	12583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009900	GCT	2	6	12636	12641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009900	A	6	6	12697	12702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009900	GTA	2	6	12703	12708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009900	GGCTC	2	10	12721	12730	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_009900	AGC	2	6	12743	12748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009900	GAT	2	6	12818	12823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009900	AAG	2	6	13014	13019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009900	TAT	2	6	13045	13050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009900	GAA	2	6	13118	13123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009900	AGCAG	2	10	13141	13150	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009900	ATA	2	6	13178	13183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009900	ATT	2	6	13188	13193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009900	TAG	2	6	13256	13261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009900	CAG	2	6	13276	13281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009900	TTAAT	2	10	13297	13306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009900	AAAT	2	8	13367	13374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009900	T	6	6	13409	13414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009900	A	7	7	13488	13494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009900	AAT	2	6	13515	13520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009900	TAG	2	6	13540	13545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009900	AGAAAA	2	12	13610	13621	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009900	TCT	2	6	13622	13627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009900	A	7	7	13628	13634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009900	TAAA	2	8	13663	13670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_009900	CAA	2	6	13692	13697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_009900	GAT	2	6	26989	26994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_009900	TA	4	8	39908	39915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_009900	ATTG	2	8	39918	39925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
442	NC_009900	T	6	6	39990	39995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_009900	ATCTTT	2	12	40005	40016	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
444	NC_009900	TAA	2	6	40041	40046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_009900	CTTTT	2	10	40047	40056	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
446	NC_009900	TAAA	2	8	40079	40086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_009900	ATTT	2	8	40184	40191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_009900	TCT	2	6	40267	40272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_009900	TAA	2	6	40282	40287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_009900	TA	3	6	40382	40387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_009900	CTT	2	6	40417	40422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_009900	TAA	2	6	40568	40573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_009900	TTTTA	2	10	40582	40591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_009900	TCA	2	6	40640	40645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_009900	AAT	2	6	40737	40742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_009900	AGAGTT	2	12	40799	40810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_009900	AGC	2	6	40915	40920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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476	NC_009900	TCT	2	6	41090	41095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_009900	ATT	2	6	42908	42913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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